制药废水水质特点主要有以下几点：①排水点多，高、低浓度废水单独排放，有利于清污分流;②高浓度废水间歇排放，需要较大的收集和调节装置;③污染物浓度高;④碳氮比低，不利于提高废水生物处理的负荷和效率;⑤含氮量高，影响COD去除;⑥硫酸盐浓度一般较高，给废水厌氧处理带来困难;⑦废水中含有微生物难以降解、甚至对微生物有抑制作用的物质;⑧水一般色度较高。

抗生素废水色度高、含多种难降解及生物毒性物质，且废水中残留的抗生素会对环境造成潜在的影响。中成药生产废水中含有大量的多环芳烃类物质，COD****可达8000～20000mg/L，BOD ****可达2500～3000mg/L，盐分总量达30000mg/L废水水质水量变化较大。合成药物生产废水组分复杂，有机污染物浓度高，且含有大量有毒有害物质，对生物活性具有较大的抑制作用，处理难度大。各类制剂生产过程中的洗涤水和冲洗废水，相对制药过程中其他废水而言，有毒有害有机物浓度大大降低，毒性较低，易于处理，可将其与其他生产废水一同处理。